Enews167 2010年暑期南加州大學藥學系電腦模擬藥物設計研習營心得
出自KMU e-News
2010年暑期南加州大學藥學系電腦模擬藥物設計研習營心得
藥學系主任 吳秀梅
藥學院為拓展學生國際視野，積極建構與世界優質大學結盟，並落實師生交流互動；今年暑假本院藥學系六位學士班學生及兩位香粧品學系碩士班學生前往南加州大學(University of Southern California, USC)藥學系參與電腦模擬藥物設計課程，本活動能順利成行，必須感謝教育部學海築夢計畫、學校教卓經費及藥學文教基金會等補助部份經費；本課程為期四週，由USC Dr. Michael Wincor負責規劃，第一週主題是structure-based drug design - small molecules，先由Dr. Haworth授課，他先給每一組一個protein，教學生如何使用ViewerPro軟體來找出它的ligand，也從最基本的生化開始講起，介紹胺基酸和蛋白質的結構和一些藥物設計的基本觀念，以及蛋白質和ligand的結合，並解說課程大綱，而其中比較特別的名詞應該是docking。老師上課時不只教投影片的內容，還會要求學生下載一些軟體馬上現場操作，像是SMILES (Simplified Molecular Input Line Entry System)，操作時一旁就有助教耐心的幫忙，讓學生得以快速進入狀況，每一天小組都要上網交一份軟體操作的作業。第二週的課程biopharmaceutics – small molecules，多了Dr. Okamoto授課，主要是利用線上免費軟體了解原始ligand的一些特性，例如親疏水性、pKa、分子量、logP、logD等，接著依照ligand的缺點做修飾。接著使用線上軟體去觀察修改後ligand的特性，也去學校的電腦教室使用GastroPlus這個軟體，這是一個模擬生物可利用率的軟體，可以從這個模擬軟體來看修飾過後的ligand是否具有好的生物可利用率。第三週課程為design & delivery of proteins & DNA therapeutics agents，也包括上台報告這個月的成果。
