Enews454 研究資源組
出自KMU e-News
高雄醫學大學e快報 第454期 研發處專題
研究資源組
■研究資源組 林英琦組長
「研究資源組」目標為提供本校研究者研究的軟硬實力支援。本組統籌管理及維護校內各式高階儀器、生物資訊軟體平台及校內共用第二級生物安全實驗室空間，提供專責技術與諮詢人員協助全校師生實驗設計及執行之諮詢服務，亦接受校內外研究人員或廠商之付費委樣服務。本組亦負責前瞻式規劃高階儀器介紹及使用之課程和工作坊，協助全校師生熟悉生物醫學研究趨勢及相關工具之發展及使用。
本組目前設立有「超導核磁共振儀貴重儀器中心」、「核酸/蛋白質體核心研究室」、「細胞分子生物影像核心研究室」與「高階生物資訊核心研究室」四大核心研究室。各核心研究室目前主要之儀器及負責人員介紹如下：
【超導核磁共振儀貴重儀器中心(貴重儀器中心)】：
本中心儀器及服務由王淇佳技佐(2289)及王重雅技佐(2371#24)負責。
1. 超導核磁共振儀：設有Agilent VNMRS - 600 NMR及Agilent Mercury plus - 400 NMR、Agilent Unity plus - 400 NMR、JEOL JNM ECS - 400 NMR，供分子結構及化學結構之鑑定及解析之用。
2. 低溫X光單晶繞射儀：利用 X射線來測量單晶繞射數據，用以分析晶體結構，包含晶體內部分子結構和原子排列等。
3. 液相層析質譜儀(ARC HPLC SQD2)：可針對小分子有機藥物、天然物等進行初步質譜定性鑑別，為送測高解析質譜儀前必備之初步鑑別。
【核酸/蛋白質體核心實驗室】：
本研究室蛋白質、藥物定量、環境或食品中之微量篩檢物質測定、關鍵生物標記之確認之分析儀器操作由李彥融技佐(2371#21)及周季賢技士(2371#27)負責。目前主要的質譜儀包含液相層析三重四極桿質譜儀(LC-TRIPLE Q MS)、液相層析串聯四極桿飛行時間式質譜儀(LC-Q TOF MS)、基質輔助雷射脫附游離飛行時間式質譜(MALDI-TOF MS)，可提供化學品和蛋白質定性和定量的測定，亦已建立蛋白質體、塑化劑代謝物、Microbiota代謝物短鏈脂肪酸(九種)分析與trimethylamine N-oxide (TMAO)以及各種藥物/毒物於生物檢體之濃度監測分析平台，歡迎洽詢服務。
本研究室亦有以下儀器提供預約使用：
1. 多重因子檢測分析平台(Multiple Immunoassays)：包含多功能分析系統(Luminex 200)、連續波長分光光度計(Multiskan SkyHigh)及微盤清洗儀(Hydroflex platform)，可搭配顏色微珠進行樣本的定性和定量分析，至多可檢測100種蛋白質分子。
2. 精準醫學核酸品質鑑定專用儀(Agilent 4150 TapeStation)：僅需微量之檢體即可鑑定核酸片段大小及純度，是做NGS分析前必要的品質檢測工具。
3. 毛細管DNA電泳定序儀：利用桑格定序技術進行基因定序，本研究室主要提供人類細胞株基因型鑑定服務。
4. 數位化聚合酶反應分析系統：利用微滴化技術增加檢測的精確性及靈敏度，且無須標準品即可針對檢體內超微量基因，進行絕對定量、基因拷貝數(copy number)變異分析、基因點突變檢測。
另有，超高速離心機、局部表面電漿共振儀(OPEN SPR)、細胞融合儀(ECM 2001)、溫和組織處理器(GentleMACS)、即時螢光核酸定量處理分析系統(QS5 Real-Time PCR)等多項儀器設備。
【細胞分子生物影像核心研究室】：
本研究室儀器和服務主要由李曉婷技佐(2371#22)及朱家瑩技佐(2371#23)負責。
1. 多色流式細胞分析分選儀(BD FACSLyric / FACSMelody)及分析軟體FLOWJO：本機型可同時偵測12種螢光顏色，可進行細胞表型、細胞功能、細胞週期、細胞凋亡等分析；亦可以在標的後運用細胞分選功能進行細胞族群分離或搭配外泌體捕獲套組分離外泌體。
2. 類流式影像自動擷取定量系統(TissueFAXS)：用來覽掃描組織切片或抹片，進行可見光及多色螢光之訊號之全景式影像擷取及自動對焦拼接，也具有單一細胞之影像訊號辨識、訊號拆解及定量等分析功能。
3. 奈米粒子追蹤分析儀(NTA)：透過粒子在電場內移動量測化學性及生物性微小粒子的顆粒大小、濃度、表面電荷和特徵。
4. 多層次螢光影像擷取與分析系統(ImageXpress Micro System，IXM)：高通量螢光顯微影像系統提供全自動高速對焦、拍照及高通量資料分析。
5. 雷射共軛焦顯微鏡：包括Olympus FV 1000 Confocal及ZISS LSM700 Confocal，可透過不同波長雷射進行螢光標示生物並可進行長時間活細胞連續記錄實驗。另有高階三維重建影像分析軟體(IMARIS)，可提供為三維/四維/多維圖像進行視覺化和定量分析的顯微影像分析。
在單細胞研究方面，可向周季賢技士(2371#27)進行詢問相關資源，設有：
1. 超高內涵組織掃描暨分析系統(CODEX)，可提供高通量組織影像擷取及分析，最多可一次觀察多達40多種組織標的物的標示分析，配合軟體高維度運算各種細胞群空間結構及互動關係，可完整建構單細胞蛋白體。
2. 自動化單細胞分子標記系統(10X Genomics Chromium Controller)：是生醫領域單細胞 NGS研究強大的工具之一，結合分子條碼和生物資訊學分析工具，了解生物體中個別細胞的基因表現與細胞特徵，用於探索組織或器官異質性，新型靶標和生物標記等研究
【高階生物資訊核心研究室】：
本研究室由洪志昌技佐(2370#25)負責。
1. 生物路徑分析軟體暨資料庫(Ingenuity Pathway Analysis，IPA)：用於系統生物學與訊息路徑分析，可以透過IPA收錄的數百萬筆生物資訊，快速尋找您感興趣的基因、疾病及分子調控方式。
2. 分子模擬分析軟體(Discovery Studio，DS)：是多功能演算預測軟體，整合了廣泛的生物與化學資訊學、分子模型建造和模擬工具，為研究人員提供易用的蛋白質序列比對、優化、AI藥物開發設計工具。
3. 高通量基因體資訊分析軟體(Partek Flow)：支援RNA-seq、single-cell RNA-seq、DNA-seq、ATAC-seq、ChIP-seq等數據分析及統計，以圖型化的介面及直覺式的分析流程設計，讓基因體學的研究者無需藉由程式語言亦能完成數據分析。
上述所有儀器及服務項目，可於中心網站(https://crrd.kmu.edu.tw/index.php/zh-tw/ )中查詢到更完整的內容及進行預約，也歡迎與相關人員進行洽詢。我們也歡迎師生們提供本組儀器採購和服務的建議，讓我們能夠持續精進及躍升本校研究能量及資源，做為本校頂尖研究發展的堅強後盾。
